北京小汤山医院位于北京市昌平区的千年温泉古镇小汤山镇，医院在正式建院以前具有悠久的历史，是历代封建王朝的皇家禁苑，最早可追溯至元代。因其丰富的温泉资源，清康熙皇帝在此修建了“汤泉行宫”，到清乾隆时期形成鼎盛全貌。晚清民国时期因战乱而破败不堪，直到新中国成立后这座百年汤泉行宫重新焕发生机。进入21世纪后，北京小汤山医院又肩负起时代赋予的光荣使命，走在了抗击非典和新冠肺炎的最前沿。如今院区内新建成的高科技诊疗中心与明代及清代汤泉行宫的部分遗址相结合，构成了现在的小汤山医院。

1958年，国务院发出《关于小汤山疗养区统一管理问题的通知》，决定将小汤山疗养区四所疗养院统一交由北京市人民委员会管理。北京市公共卫生局将合并后的疗养院定名为‘北京市小汤山疗养院’，对疗养院的性质、收治对象、疗养方针作出了明确规定。

四所疗养院分别为：首建中国人民解放军123疗养院（1/E）、中央卫生部小汤山疗养院（2/D）、全总小汤山温泉疗养院（3/C）、中国人民解放军l07疗养院（4/A）。1958年8月15日，北京市小汤山疗养院正式宣布成立，同年9月1日完成供给移交，结束了四院并立各行其政，汤泉行宫被分割的局面。1958年北京市小汤山疗养院的正式成立，也标志着新中国疗养事业新纪元的开创，直到2022年北京小汤山疗养院的铭牌才正式取消。

在经济恢复时期，毛主席曾来院视察，周总理多次来院探视知名人士，在此疗养的中央领导和老一代无产阶级革命家有刘少奇、朱德、彭德怀、刘伯承、贺龙、陈毅、徐向前、聂荣臻等。曾在此疗养的著名文艺界人士有梅保玖、新凤霞等，著名作家有老舍、王观澜等。